ความหลากหลายของกล้วยไม้บริเวณอุทยานแห่งชาติเขานัน จังหวัดนครศรีธรรมราช (พ.ศ.2549-2550) โดย ชุมพล คุณวาสี, ต่อศักดิ์ สีลานันท์, อบฉันท์ ไทยทอง

ความหลากหลายของเทอริโดไฟต์ บริเวณอุทยานแห่งชาติเขานัน จังหวัดนครศรีธรรมราช (พ.ศ.2549-2550) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, ปริญญนุช ดรุมาศ, สหัช จันทนาอรพินท์

การศึกษาทบทวนมอสส์วงศ์ Sematophyllaceae ในประเทศไทย (พ.ศ.2548-2550) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, รสริน พลวัฒน์, Jan-Peter Frahm

ความหลากหลายของไบรโอไฟต์ในอุทยานแห่งชาติทองผาภูมิ จังหวัดกาญจนบุรี (พ.ศ.2547-2549) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, รสริน พลวัฒน์, สหัช จันทนาอรพินท์ และ Ming-Jou Lai

พรรณไม้ในบริเวณพระจุฑาธุชราชฐาน เกาะสีชัง จังหวัดชลบุรี (พ.ศ.2547-2548) ในนามของภาควิชาพฤกษศาสตร์โดยมี รศ.นันทนา  อังกินันทน์ เป็นหัวหน้าโครงการ และผู้ร่วมวิจัย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, อบฉันท์ ไทยทอง, บุศบรรณ ณ สงขลา, วิยดา เทพหัตถี, พัชรา ลิมปนะเวช, ชุมพล คุณวาสี, ต่อศักดิ์ สีลานันท์, ศุภจิตรา ชัชวาลย์, พงศ์ธาริน โล่ห์ตระกูล, ธีรดา หวังสมบูรณ์ดี, เรืองวิทย์ บรรจงรัตน์, ชนิตา ปาลิยะวุฒิ, ปริญญนุช ดรุมาศ, ฐปนา บางยี่ขัน, สหัช จันทนาอรพินท์

การศึกษาทบทวนพืชวงศ์ Lycopodiaceae ในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ (พ.ศ.2547-2548) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, รสริน พลวัฒน์ และปริญญนุช ดรุมาศ

ความหลากหลายด้านชนิดของพรรณไม้ในบริเวณพื้นที่โครงการจัดตั้งสถาบันเทคโนโลยีชั้นสูง จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ตำบลไหล่น่าน อำเภอเวียงสา จังหวัดน่าน โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, ชุมพล คุณวาสี, ต่อศักดิ์ สีลานันท์, ปริญญนุช ดรุมาศ ภายใต้โครงการ ....(พ.ศ.2546-2548) โดยมี รศ.จริยา เล็กประยูร เป็นหัวหน้าโครงการ

ความหลากหลายและความสัมพันธ์ทางสายพันธุ์ของกล้วยตานี (Musa balbisiana Colla) เครือญาติ และลูกผสม (พ.ศ.2545-2548) โดย ต่อศักดิ์ สีลานันท์ ศศิวิมล แสวงผล และ Hugo Volkaert

ความหลากหลายและนิเวศวิทยาของเทอริโดไฟต์ในป่าธรรมชาติและป่าที่ถูกรบกวนในพื้นที่ทองผาภูมิตะวันตก (พ.ศ.2545-2546) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด และ รสริน พลวัฒน์

พรรณไม้ที่มีระบบท่อลำเลียงบริเวณในพุพื้นที่อำเภอทองผาภูมิฝั่งตะวันตก จังหวัดกาญจนบุรี (พ.ศ.2545-2546) โดย ปริญญนุช ดรุมาศ, ชุมพล คุณวาสี และ ต่อศักดิ์ สีลานันท์

การศึกษาสัณฐานวิทยาของเรณูพืชวงศ์เปล้า (Euphorbiaceae) ในประเทศไทย (พ.ศ.2540-2543)โดย โกสุม พีระมาน, ชุมพล คุณวาสี, กัญดา เกษตรสินสมบัติ และ รัฐพงษ์ พวงทับทิม

ความหลากหลายของพรรณไม้บริเวณวนอุทยานน้ำตกขุนกรณ์ จังหวัดเชียงราย (พ.ศ.2540-2543) โดย ทวีศักดิ์ บุญเกิด, จิรายุพิน จันทรประสงค์, อบฉันท์ ไทยทอง, บุศบรรณ ณ สงขลา, รสริน พลวัฒน์, ปริญญนุช กลิ่นรัตน์, ปิยพงษ์ ราชตา, สุชาดา วงศ์ภาคำ และสำนักงานป่าไม้จังหวัดเชียงราย