ฝ่ายบริหาร คณะวิทยาศาสตร์ มีระบบการบริหารจัดการที่แยกการทำงานออกเป็นหน่วยงานต่างๆ 5 งาน ดังนี้

1. งานบริหารและธุรการ
2. งานคลัง
3. งานพัสดุ
4. งานอาคารสถานที่และยานพาหนะ
5. งานพัฒนาและบริการเครื่องมือวิทยาศาสตร์